评估不同技术平台检测表皮生长因子受体(EGFR)突变的能力,包括T790M,来自晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者的循环肿瘤DNA(ctDNA)。
材料和方法
进行了用于检测血浆ctDNA中EGFR突变的多个平台的比较。从进入正在进行的AURA试验(NCT01802632)的患者收集血浆样品,研究
AZD9291在EGFR致敏突变阳性NSCLC患者中的安全性,耐受性和功效。在AZD9291给药之前收集血浆,但是在之前的EGFR-酪氨酸激酶抑制剂(TKI)上进行临床进展。使用两个非数字平台(cobas EGFR突变测试和therascreen TM EGFR扩增难治性突变系统测定)和两个数字平台(Droplet Digital TM PCR和BEAMing数字PCR[dPCR])分析提取的ctDNA。
结果
使用所有四个平台进行初步评估(38个样本)。对于EGFR-TKI致敏突变,使用组织作为非参考标准观察到高灵敏度(78-100%)和特异性(93-100%)。对于T790M变异,数字平台的表现优于非数字平台。使用72个附加基线血浆样品以后的评估是使用COBAS进行®EGFR突变试验和整经DPCR。这两个平台对EGFR致敏突变表现出高灵敏度(82-87%)和特异性(97%)。对于T790M突变,灵敏度和特异性分别为73%和67%,与COBAS®EGFR突变试验,BEAMing dPCR分别为81%和58%。平台之间的一致性>90%,表明多个平台能够敏感和特异性地检测来自NSCLC患者血浆的EGFR-TKI敏化突变。
结论
在COBAS®EGFR突变试验和放光DPCR演示了T790M突变检测灵敏度高。T790M介导的抗性的基因组异质性可以解释基于血浆的T790M突变与组织相比检测到的特异性降低。这些数据支持在
AZD9291临床开发计划中使用这两个平台。